Manson citou Philip K. Dick como uma inspiração e disse que o filme Blade Runner teve um impacto substancial nele quanto assistiu na infância. Muitos paralelos podem ser desenhados entre esse filme e as várias facetas no trabalho do Manson (particularmente na Triptych) e persona, tanto que deve ser examinado. Esteticamente falando, a homenagem mais óbvia ao Blade Runner, é a emulação da maquiagem de Daryl Hanna que Manson fez.

Manson sempre esteve conectado em diferentes capacidades à Aleister Crowley desde o "Portrait of an American Family." "The Abbey of Thelema" cantado na música "Misery Machine" é uma referência à matriz de Crowley, onde ele ensinou sua magia para os adeptos. Várias letras dentro do "Holy Wood" e "Antichrist Svperstar" ou são citações ou paráfrases dos textos de Crowley. Até mesmo as eras mais recentes, como a "Celebritarian" e "Eat Me, Drink Me" do MarilynManson.com (2006 - 2007 respectivamente) conteve áudio de Crowley recitando uma encarnação mágica.

Frequentemente conhecido como "A Grande Besta 666" e referido por muitos (incluindo em seu obituário) como "o homem mais perverso que já viveu," ele foi um dos poetas/escritores/filósofos mais prolíficos do século XX e desenvolveu seu próprio sistema de magia. Até o popular termo "magia" ("magick") foi cunhado por Aleister Crowley. Ele ainda continua como uma das figuras mais enigmaticas e mal interpretadas na história (de algum jeito muito como o Manson).

"All that glitters is cold" Manson canta através de um modulador de voz na "Posthuman." Durante a era "Mechanical Animals," Manson personificou o Omega, um rockstar vazio e exagerado que cantava hinos vazios sobre sexo, drogas e fama. O aparentemente vazio Omega, era para atuar como uma contraparte ao lado revertido e introspectivo do álbum. Manson mateve-se com significados numerológicos, dividindo ambos aspectos do álbum na metade com 7 músicas cantadas pelo fictício "Omega & the mechanical Animals" e as outras 7 músicas sendo o lado sincero, melancólico e introspectivo do álbum.

Uma famosa alusão à Shakespeare, e dualmente aos deuses do Rock n´ Roll do passado, fizeram com que Manson invertesse a letra para ilustrar os conceitos do álbum.

"Ela me contou que eu sou uma linda bala, uma imitação de Cristo/Tenho canções de amor na minha cabeça, nos matando" Letra da música "The Love Song," uma das músicas mais importantes no "Holy Wood," que ilustra o caráter do que o álbum representa; uma acusação do crescimento na cultura da América violentamente predisposta e obcecada com a morte. Como Manson disse ao longo da gravação do "Holy Wood," o álbum foi intencionado a ser uma reinterpretação do Cristianismo e suas originais tradições esotéricas, ao invés de tentar destruir completamente a religião como foi feito no "Antichrist Svperstar." O verso específico, embora ilustre dualmente a persona de Cristo que Manson retratou na capa do álbum, junto com os temas dentro dele, também faz referência a um livro do século XV no Misticismo Cristão conhecido como "The Imitation of Christ"

A imagem do Baphomet é uma que o Manson tem evocado frequentemente em sua arte. A representação mais conhecida, como colocada à esquerda, foi desenhada no meio do século XIX pelo mágico Eliphas Levi, que também ilustrou a representação do pentagrama do Tetragrammaton que apareceu dentro do encarte do "Holy Wood."

Muito similar ao Tetragrammaton, tematicamente o Baphomet é representado pelo mesmo conceito na magia e Oculto. O Cristianismo incompreendeu completamente o que o Baphomet representava, acredita-se ser o deus que os pagãos adoraram, aqueles que procuraram para subjulgar e converter, assim construindo a imagem como a antítese do Cristianismo e, portanto, a personificação de seu Satã, muito similarmente ao que foi feito com o Pentagrama e por que hoje na consciência popular é inerentemente definido como algo "maléfico."